Presso il Reparto di Degenza dell'Unità Operativa di Pediatria Multispecialistica vengono ricoverati bambini che necessitano della diagnosi e della cura di malattie acute di comune riscontro in età pediatrica come: malattie infettive dell'infanzia senza necessità di isolamento (polmoniti, infezioni della alte vie aeree, linfoadeniti, gastroenteriti, infezioni urinarie, ecc); febbre ricorrente o da causa sconosciuta; disturbi dell'alimentazione o della crescita; malattie infiammatorie croniche intestinali, apnee del lattante e malattia da reflusso; asma bronchiale, bronchiolite, laringite; convulsioni e perdite di coscienza; malattie dell'apparato muscolo-scheletrico (quali miopatie, osteomieliti ed artrite settiche; accrescimento ponderale eccessivo o distrofia); connettivopatie ed altre malattie autoimmuni. 

Vengono inoltre ricoverati pazienti con disabilità, patologie croniche o riacutizzate, che per la loro fragilità e complessità assistenziale necessitino di accertamenti, valutazioni o trattamenti in regime di ricovero ordinario. Si tratta di bambini con gravi stati di malnutrizione tali da richiedere avvio alimentazione enterale o parenterale, pazienti tracheostomizzati con insufficienza respiratoria cronica riacutizzata da episodi infettivi intercorrenti, o che necessitano di monitoraggio continuativo dei parametri vitali per avvio ventilazione meccanica domiciliare, pazienti con disfagia grave, epilessia e stati distonici, osteoporosi, problematiche metaboliche, endocrinologiche ed ortopediche tali da richiedere una gestione integrata con tutti i colleghi specialisti presenti presso la sede, delle numerose problematiche cliniche. Vengono ricoverati circa 1500 pazienti all'anno.