Il microbiota

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08 aprile 2016

Che cos'è

L'uomo è un "super-organismo", il risultato della combinazione simbiotica del suo patrimonio genetico e del suo "microbiota", un ecosistema batterico molto complesso con un elevato grado di diversità nelle specie che lo compongono e caratterizzato da funzioni metaboliche, immunologiche e fisologiche diversificate e "specializzate". L'insieme dei microorganismi che costituiscono il microbiota intestinale, un tempo denominato flora intestinale, svolge un ruolo fondamentale nella salute umana soprattutto per lo sviluppo del sistema immunitario del neonato, agendo come barriera contro i patogeni. Quando l'equilibrio da loro garantito (definito "eubiosi" o "normobiosi") viene perturbato si innesca un processo di alterazione del microbiota (definito "disbiosi") che gioca un ruolo centrale nell'insorgenza e progressione di molte malattie, compresa l'obesità, gli stati allergici, le malattie infiammatorie intestinali e le alterazioni metaboliche.

Il microbiota di un bambino

Il microbiota di un bambino nel primo anno di vita è molto diverso da quello di un adulto. Questa diversità è riscontrabile sia in termini di complessità batterica, ossia numero delle diverse specie batteriche presenti, sia in termini di stabilità delle specie, ossia variabilità e risposta agli stimoli esterni, aspetto fondamentale specialmente nelle prime fasi di vita. Anche l'ecologia microbica è fortemente dipendente dagli stimoli esterni, rappresentati prevalentemente da cibo, modalità di parto, etc., fattori che tutti insieme costituiscono l'esposoma.

Durante il periodo di allattamento e svezzamento del bambino l'ampio sistema di batteri del microbiota è soggetto a oscillazioni che danno origine a un'alta variazione nella composizione e funzione. L'allattamento materno potenzia fortemente il numero delle cosiddette specie "buone", come Lattobacilli e Bifidobatteri. Con l'introduzione di cibo solido nella dieta del bambino (svezzamento) comincia tutta una serie di attività più ricche, metaboliche e proteomiche. In questa fase il numero delle specie microbiche e delle molecole attive, dette "bioattive", aumenta in maniera considerevole sviluppando attività specifiche. Nella fascia di età dei primi 18 mesi di vita del neonato il microbiota si forma, via via si stabilizza e progressivamente somiglia sempre di più a quello presente in un adulto.

Le metodologie di laboratorio avanzate per lo studio

Lo studio della popolazione batterica che forma il microbiota intestinale rende necessario l'utilizzo di piattaforme tecnologiche in grado di deframmentarne la complessità:
- sequenziatori di "next generation sequencing" (NGS), per descriverne i genomi batterici;
- spettrometri di massa, per scoprire l'intero serbatoio di metaboliti e proteine prodotti dalla grande moltitudine di popolazioni microbiche. Si parlerà, pertanto, di microbiomi, metabolomi, metaproteomi analizzati mediante metodi sperimentali e informatici descritti come metagenomica, metabonomica-metabolomica e metaproteomica.

I dati generati, cosiddetti "big data", devono poi essere integrati mediante metodi di biologia computazionale avanzata, che permette di analizzare milioni di genomi, di metaboliti e di proteine in un sistema integrato. Questo sistema viene correlato poi con i dati clinici del paziente e si generano i profili fenomici, in cui i quadri di microbiota possono giocare un ruolo di predittori di malattia insieme a variabili genetiche,immunologiche, ambientali.

«Gli studi sul microbioma intestinale sono fondamentali in pediatria per evidenziare la correlazione tra profili microbici e metabolici e principali patologie correlate ad alterazioni gastrointestinali – spiega Lorenza Putignani, responsabile dell'Unità di Parassitologia e dell'Unità di Ricerca di Microbioma Umano del Bambino Gesù. Si apre così una nuova medicina dei sistemi, in grado di evidenziare il ruolo delle comunità microbiche nell'insorgenza e progressione delle patologie, aspetto fondamentale soprattutto nel periodo di crescita del bambino, quando si gettano le basi per "preparare" lo stato di salute durante tutte le fasi successive di vita dall' infanzia, alla vita adulta, alla senescenza».

L'Ospedale Pediatrico Bambino Gesù ha costituito un Consortium clinico-laboratoristico per studiare i profili di microbiota connessi alle condizioni fisiologiche di salute ("programming" e allattamento, svezzamento, introduzione cibi solidi) ma anche alle condizioni patologiche, studiando le principali patologiche pediatriche e croniche per comprendere il quadro di avanzamento delle ultime dall'età infantile all'età adulta.

Alimentazione e microbiota

La nutrizione è molto importante per il mantenimento del microbiota sano e per la sua corretta modulazione. Una tipologia sana di alimentazione è la dieta cosiddetta mediterranea, ricca di apporti nutritivi molto importanti che facilitano tutte quelle componenti microbiche che hanno un metabolismo altamente positivo per l'ospite (bassa somministrazione di grassi saturi, un buon apporto di carboidrati e un contenuto apporto proteico). Alternativamente, anche quando l'alimentazione è supportata da probiotici o prebiotici, possiamo avere delle ricadute positive sul microbiota, anche in età infantile.
La somministrazione dei probiotici deve essere ora considerata in una nuova veste. Per saperne di più >>

Il test del microbiota intestinale in OPBG

L'analisi del microbiota intestinale viene eseguita mediante tecniche di sequenziamento di seconda generazione (NGS) attraverso le quali è possibile identificare la totalità della flora microbica intestinale, realizzando una vera e propria "mappa" descrittiva dei batteri presenti nei campioni fecali del paziente. L'analisi è un esame di laboratorio e, come tale, necessita della corretta interpretazione del clinico che segue il paziente.

Per l'esecuzione del test, si possono seguire le indicazioni riportate alla seguente pagina "Struttura Semplice di Parassitologia"

1. Scarica l'informativa per l'analisi del Microbiota >>

2. Scarica il questionario da consegnare insieme ai campioni di feci per analisi del microbiota >>

Per ulteriori informazioni, scrivere una mail al seguente indirizzo di posta elettronica: microbiota@opbg.net