Microbiomica

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Responsabile 

Lorenza Putignani



L’Unità Operativa Semplice di Microbiomica è il laboratorio che si occupa della parte diagnostica delle principali patologie parassitarie.
E' organizzato in linee analitiche per analisi dirette (microscopia qualitativa e quantitativa), indirette (sierologia), di biologia molecolare, colturali e di Next Generation Sequencing (NGS, metagenomica targeted e di shot-gun, whole genome sequencing) per la caratterizzazione di:

  • endoparassiti
  • comunità microbiche complesse, incluse batterioma, micoma, viroma e parassitoma
     

In particolare, l'Unità di Microbiomica si occupa dei seguenti esami:

  • Microbiota intestinale, vaginale, urinario e delle vie aeree
  • Parassiti a trasmissione zoonotica e antroponotica: Cyclospora cayetanensis, Dientamoeba fragilis, Cryptosporidium parvum e Cryptosporidium hominis, Blastocystis hominis, Giardia intestinalis, Entamoeba histolytica, Ascaris lumbricoides, Anisakis spp., Strongyloides stercoralis, Schistosoma spp.
  • Scotch test
  • Ricerca microscopica di microfilarie ematiche
  • Malaria, in urgenza e routine, con identificazione in microscopia, indice di parassitemia, PCR, antigenemia di Plasmodium spp. a livello di specie
  • Leishmaniosi in microscopia e PCR real-time di Leishmania spp. (cutanea e viscerale)
  • Toxoplasmosi in PCR real-time di Toxoplasma gondii
  • Borrelliosi, rickettsiosi, ehrlichiosi in microscopia e PCR real-time

 

Le matrici biologiche principalmente analizzate sono:

  • Aspirati tissutali: midollo, lavaggio bronco-alveolare, aspirato bronchiale
  • Biopsie: cute, linfonodi, espettorato, liquor, tamponi vaginali, uretrali
  • Sangue periferico e siero
  • Feci e tamponi rettali
  • Urine
 
 

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