Il primo accesso avviene in genere in ambulatorio, previo appuntamento. Si prenota al Centro Unico di prenotazione, sia telefonicamente sia online. L'Unità svolge le sue attività anche in regime di day hospital, day surgery e ricovero ordinario. 

L'Unità operativa di Ortopedia del Bambino Gesù è specializzata nei seguenti ambiti: 

• Chirurgia vertebrale 
• Neuro Ortopedia 
• Chirurgia  artroscopica del ginocchio e della spalla 
• Chirurgia dell'anca  
• Chirurgia del piede  
• Deformità congenite ( piede torto, displasia dell'anca). 
• Impianto Pompa di Baclofen 
• Oncologia ortopedica pediatrica 
• Chirurgia delle gravi deformità degli arti sia di tipo congenito che acquisito  
• Traumatologia 
   

In particolare, gli interventi di Chirurgia vertebrale eseguiti dall'Unità di Ortopedia, sono volti alla cura delle deformità complesse di varie eziologie (scoliosi idiopatiche, neurologiche, sindromiche). Esegue interventi precoci di correzione con barre magnetiche per la cura di gravi scoliosi infantili. L'Unità Operativa come centro depositario delle maggiori casistiche nazionali ed uno degli ospedali di riferimento in campo europeo. 
Gli interventi di Neuro Ortopedia vengono eseguiti per curare delle deformità ortopediche secondarie a malattie neuromuscolari. L'Ortopedia del Bambino Gesù svolge tutte le procedure descritte in letteratura quali l'impianto di pompa al baclofen, la chirurgia percutanea fibrotomica, gli allungamenti e trasposizioni miotendinee, osteotomie ed artrodesi. L'Unità operativa è centro di riferimento nazionale per la cura della spasticità, con una casistica tra le più importanti in ambito nazionale. In questo ambito viene eseguito anche il trattamento con tecnica percutanea fibrotomica, un trattamento innovativo mininvasivo. 
La Chirurgia delle deformità complesse degli arti inferiori riguarda le deformità degli arti inferiori quali dismetrie, acondroplasia, deviazioni assiali e torsionali degli arti. Vengono eseguiti interventi correttivi sia utilizzando sistemi di sintesi e "correzione guidata di crescita" interni studiati appositamente per l'età pediatrica, sia utilizzando apparecchi di fissazione esterna assiali o circolari. All'occorrenza vengono utilizzati anche sistemi di fissazione esterna più recenti, i fissatori esterni esapodalici, che utilizzano programmi computerizzati per effettuare le correzioni. L'unità Operativa è inoltre centro di riferimento nell'applicazione dei nuovissimi sistemi di allungamento e correzione che utilizzano chiodi magnetici endomidollari interni. 
Il trattamento del Piede Torto Congenito secondo Ponseti, che prevede l'applicazione di apparecchi gessati correttivi fin dai primi giorni di vita e l'allungamento chirurgico mininvasivo del tendine d'Achille.  
Il trattamento della Displasia Congenita dell'Anca viene eseguito precocemente dopo un esame ecografico. Questo consente di curare questa patologia in modo conservativo attraverso l'applicazione di un tutore, limitando quindi il trattamento chirurgico e con apparecchi gessati ad un numero sempre più ristretto di casi.